Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd2P62317 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd2P62317 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd2P62317 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms