Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc5P62196 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc5P62196 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms