Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp46P62069 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp46P62069 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp46P62069 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp46P62069 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp46P62069 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp46P62069 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp46P62069 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp46P62069 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp46P62069 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp46P62069 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp46P62069 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp46P62069 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp46P62069 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp46P62069 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp46P62069 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp46P62069 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp46P62069 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp46P62069 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp46P62069 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms