Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psme3P61290 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme3P61290 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms