Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CirbpP60824 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CirbpP60824 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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