Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup43P59235 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup43P59235 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup43P59235 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup43P59235 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms