Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gsc2P56916 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms