Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd5P56812 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms