Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox17P56394 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox17P56394 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox17P56394 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms