Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CdaP56389 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CdaP56389 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CdaP56389 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CdaP56389 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CdaP56389 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CdaP56389 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CdaP56389 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CdaP56389 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CdaP56389 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CdaP56389 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CdaP56389 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms