Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5eP56382 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5eP56382 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5eP56382 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5eP56382 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5eP56382 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5eP56382 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5eP56382 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms