Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsc2P55292 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsc2P55292 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 926.2 ms