Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd3P55096 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms