Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb3P54754 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms