Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Faf1P54731 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Faf1P54731 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Faf1P54731 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Faf1P54731 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Faf1P54731 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Faf1P54731 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Faf1P54731 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Faf1P54731 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms