Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1cP52432 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1cP52432 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1cP52432 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms