Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FanccP50652 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FanccP50652 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FanccP50652 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FanccP50652 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FanccP50652 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FanccP50652 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FanccP50652 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FanccP50652 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FanccP50652 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FanccP50652 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FanccP50652 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FanccP50652 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FanccP50652 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FanccP50652 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FanccP50652 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FanccP50652 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FanccP50652 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FanccP50652 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FanccP50652 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FanccP50652 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FanccP50652 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FanccP50652 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FanccP50652 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FanccP50652 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FanccP50652 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FanccP50652 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FanccP50652 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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