Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HpdP49429 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HpdP49429 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HpdP49429 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HpdP49429 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HpdP49429 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HpdP49429 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HpdP49429 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HpdP49429 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HpdP49429 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HpdP49429 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HpdP49429 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HpdP49429 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HpdP49429 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HpdP49429 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HpdP49429 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HpdP49429 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HpdP49429 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HpdP49429 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HpdP49429 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HpdP49429 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HpdP49429 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HpdP49429 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HpdP49429 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HpdP49429 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HpdP49429 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HpdP49429 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HpdP49429 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HpdP49429 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HpdP49429 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HpdP49429 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HpdP49429 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HpdP49429 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HpdP49429 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms