Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx2P48379 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx2P48379 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx2P48379 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx2P48379 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx2P48379 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx2P48379 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx2P48379 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx2P48379 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx2P48379 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx2P48379 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx2P48379 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx2P48379 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx2P48379 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx2P48379 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx2P48379 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx2P48379 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx2P48379 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx2P48379 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx2P48379 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms