Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl5P47962 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl5P47962 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms