Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f2P43135 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms