Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtgfrP43117 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtgfrP43117 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtgfrP43117 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms