Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept1P42209 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept1P42209 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms