Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf2P39429 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf2P39429 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf2P39429 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf2P39429 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf2P39429 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf2P39429 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf2P39429 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf2P39429 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Traf2P39429 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms