Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtlP38585 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtlP38585 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TtlP38585 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtlP38585 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtlP38585 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtlP38585 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtlP38585 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtlP38585 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtlP38585 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtlP38585 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtlP38585 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtlP38585 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtlP38585 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtlP38585 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TtlP38585 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtlP38585 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtlP38585 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TtlP38585 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtlP38585 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtlP38585 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtlP38585 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms