Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox5P35710 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox5P35710 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms