Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddit3P35639 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddit3P35639 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms