Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa1P35175 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa1P35175 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa1P35175 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms