Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OatP29758 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OatP29758 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OatP29758 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OatP29758 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OatP29758 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OatP29758 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OatP29758 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OatP29758 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OatP29758 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OatP29758 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OatP29758 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OatP29758 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OatP29758 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OatP29758 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OatP29758 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OatP29758 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OatP29758 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OatP29758 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OatP29758 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OatP29758 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OatP29758 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OatP29758 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OatP29758 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OatP29758 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms