Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RxraP28700 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RxraP28700 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxraP28700 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxraP28700 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxraP28700 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxraP28700 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxraP28700 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxraP28700 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxraP28700 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxraP28700 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxraP28700 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxraP28700 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxraP28700 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxraP28700 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxraP28700 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxraP28700 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxraP28700 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxraP28700 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxraP28700 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxraP28700 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxraP28700 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxraP28700 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxraP28700 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxraP28700 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxraP28700 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxraP28700 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxraP28700 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RxraP28700 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RxraP28700 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxraP28700 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxraP28700 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxraP28700 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxraP28700 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxraP28700 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxraP28700 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxraP28700 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RxraP28700 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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