Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NapbP28663 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NapbP28663 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NapbP28663 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NapbP28663 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NapbP28663 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NapbP28663 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NapbP28663 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NapbP28663 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NapbP28663 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NapbP28663 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NapbP28663 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NapbP28663 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NapbP28663 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NapbP28663 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NapbP28663 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NapbP28663 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NapbP28663 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NapbP28663 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NapbP28663 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NapbP28663 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NapbP28663 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NapbP28663 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NapbP28663 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NapbP28663 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NapbP28663 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NapbP28663 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NapbP28663 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NapbP28663 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NapbP28663 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NapbP28663 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NapbP28663 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NapbP28663 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NapbP28663 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NapbP28663 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NapbP28663 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NapbP28663 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NapbP28663 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NapbP28663 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NapbP28663 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NapbP28663 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NapbP28663 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NapbP28663 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms