Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja8P28236 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja8P28236 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms