Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd247P24161 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd247P24161 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd247P24161 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd247P24161 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd247P24161 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd247P24161 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms