Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc6P23475 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc6P23475 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms