Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggta1P23336 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms