Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RarbP22605 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RarbP22605 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RarbP22605 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RarbP22605 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RarbP22605 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RarbP22605 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RarbP22605 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RarbP22605 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RarbP22605 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RarbP22605 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RarbP22605 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RarbP22605 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RarbP22605 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RarbP22605 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RarbP22605 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RarbP22605 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RarbP22605 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RarbP22605 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RarbP22605 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RarbP22605 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RarbP22605 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RarbP22605 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RarbP22605 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RarbP22605 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RarbP22605 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RarbP22605 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RarbP22605 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RarbP22605 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RarbP22605 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms