Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb4P21440 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb4P21440 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms