Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prim1P20664 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prim1P20664 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prim1P20664 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim1P20664 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prim1P20664 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms