Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SagP20443 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SagP20443 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SagP20443 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SagP20443 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SagP20443 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SagP20443 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SagP20443 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SagP20443 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms