Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms