Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk1P11440 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms