Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P10404 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P10404 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P10404 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P10404 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P10404 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P10404 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P10404 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P10404 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
P10404 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P10404 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
P10404 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P10404 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P10404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms