Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl2P10148 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl2P10148 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms