Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Schip1P0DPB4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms