Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CatspereP0DP43 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms