Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf1P09925 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Surf1P09925 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms