Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax1P09084 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax1P09084 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms