Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa5P09021 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms