Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NeflP08551 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NeflP08551 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeflP08551 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeflP08551 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeflP08551 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeflP08551 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeflP08551 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NeflP08551 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NeflP08551 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NeflP08551 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NeflP08551 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NeflP08551 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NeflP08551 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeflP08551 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeflP08551 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeflP08551 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeflP08551 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NeflP08551 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeflP08551 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms