Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spta1P08032 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spta1P08032 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spta1P08032 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spta1P08032 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spta1P08032 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spta1P08032 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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